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臍血庫的運行依賴收取自體庫的細胞儲存費和銷售公共庫的干細胞維持運轉。干細胞儲存機構主要技術流程是：
①與產婦或家屬簽署知情同意書或臍血儲存協議；
②對產婦進行健康檢查，排除攜帶重要病原可能及是否存在遺傳變異等；
③在產婦分娩時收集新生兒臍帶血，用來保存新生兒的臍帶血；
④實驗室中分離制備臍血干細胞；
⑤檢驗合格后置于-196℃環境(液氮)中長期儲存。
為減少操作程序，避免造血干細胞損失，一些臍血庫直接將采集獲得的臍血全部凍存，需要使用時再復蘇和分離純化。
對于自體應用的臍血可復蘇后不進行干細胞分離純化，干細胞儲存機構直接用于臨床治療，但要考慮凍存添加成分是否符合臨床治療要求。臍帶血富含造血干細胞，是繼骨髓、動員外周血之外的造血干細胞新來源，而且屬于廢棄物的重新利用，具有重要的收儲意義和醫學價值。
臍血庫的主要功能是將新生兒的醫療廢棄物臍血、臍帶及胎盤中的干細胞收集儲存起來，為需要造血干細胞移植的患者儲備資源和提供干細胞的配型查詢，提供干細胞給社會用于疾病治療和健康保健等。臍血儲存的價值在于其中含有一定數量的造血干細胞，可用于疾病治療。
臍血中造血干細胞的含量在0.5%~1.5%，還有少量血管干細胞等，主要功能是重建造血免疫功能。干細胞儲存機構全球臍血干細胞的應用已超過5萬例，主要用于白血病、再生障礙性貧血、嚴重自身免疫性疾病、放射病等疾病治療，也有人研究用于健康保健和脊髓損傷治療等取得一定療效。
